Fødevarekvalitet silikoneslange anbefales generelt ikke at komme i direkte kontakt med desinfektionsmidler. Selvom silikonerør i nogle tilfælde kan tåle visse kemikalier, indeholder desinfektionsmidler ofte stærke oxidanter, chlorider, alkoholer eller andre ætsende og reaktive kemiske komponenter, der kan reagere med silikonegel, hvilket forårsager overfladekorrosion, hærdning, misfarvning eller ydeevneforringelse af silikonerøret.
For eksempel, selvom reaktionen mellem natriumhydroxid og silikonegel er relativt mild ved stuetemperatur, kan den undergå en voldsom reaktion ved høje temperaturer, hvilket påvirker ydeevnen af silikonerør. På samme måde har klorholdige desinfektionsmidler såsom natriumhypochlorit stærke oxiderende egenskaber og kan beskadige den kemiske struktur af silicagel. Selvom alkoholdesinfektionsmidler er mindre irriterende, kan langtidseksponering også have negative virkninger på silikonegel.
